La Biblioteca è dotata di cospicue raccolte (circa 8500 manoscritti), che spaziano dal X secolo all'attuale (in particolare dei secoli XVI - XIX).
Le raccolte sono prevalentemente di interesse documentario, storico e testuale, ma comprendono anche pezzi di notevole rarità bibliofilica e valore artistico e antiquario. Il nucleo originale, proveniente dalle biblioteche delle corporazioni religiose soppresse in età napoleonica, si è via via accresciuto grazie agli acquisti e alle donazioni di eruditi collezionisti e personaggi di spicco della vita cittadina.